现在有了PET-MR，可以将PET和MR两个检查就做一次就都有了。既能通过磁共振看到结构的、功能的改变，也能通过PET看到分子成像上的改变，这两个信息就可以综合起来，进行更好的诊断。
比如老年痴呆病理改变是淀粉样蛋白沉积，或者Tau蛋白沉积，这就是分子成像，要用特异性探针，比如我们现在做的这种针对淀粉样蛋白沉积的18F-AV45示踪剂，就能看到这个。但是判断看到沉积部位在哪里，就需要通过磁共振从结构上来看，综合来诊断。还有一些癫痫患者，有些在磁共振上是能看到的，比如说海马硬化的这些病人，可能外科就直接做手术了。
但还有一些磁共振上看不到特别明显的病灶，或者是特别细微的改变，没办法来明确，但又是癫痫反复发作，这些叫磁共振阴性癫痫患者，药物没法控制，需要做手术。术前必须要明确病灶，所以这时候可以做一个PET检查，能发现发作期间的低代谢，但还是要做解剖定位。现在PET-MR同步之后，病人就做一次检查，既看到了代谢减低的病灶部位，那么看到磁共振上准确的定位。
基本上阴性患者90%都能在PET上看到低代谢。如果PET和MR分开做，那后处理的时间就会比较长，另外毕竟不是同时扫描的，所以在图像配准上有可能会有一些误差。一体化PET/MR给神经疾病诊断带来了很多优势。
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